En 2008 el equipo atravesó una grave crisis económica, que terminó con la dimisión del presidente y una declaración de bancarrota de la institución. Campeonato Regional de Castilla, en el que finalizó en tercera posición por detrás del Rayo Club, equipo con el que por aquel entonces disputaba la supremacía de Castilla hasta que estallase la Guerra Civil Española. Después de que la Federación de Irlanda les negara la plaza en Primera División por insolvencia económica, Cork City desapareció 23 de febrero de 2010 y se refundó como cooperativa.
